9ème Journée MNSN - Jeudi 11 décembre 2025

 

9th Rouen Workshop/Conference on
Math Modelling and Numerical Simulations

9èmes Journées 
Modélisation Mathématique et Simulation Numérique pour
le traitement d'image, l'énergie, le développement durable et la morphodynamique côtière.

      

Avec le soutien de :


   

FR CNRS 3335
Normandie Mathématique

Projet Scale Op

MNSN et CRIANN

Organisation :

            

Christian Gout (LMI et AMIES) et Georges Sadaka (LMRS).

 

  • Date : Jeudi 11 Décembre 2025
  • Salle principale : Amphi Marie Curie (Dumont d'Urville - BRJ 02) - INSA Rouen Normandie
  • Programme :
     
    Matinée industrielle : 

    Accueil « breakfast »  9h – Bougainville R2.01

    10h : Echanges et discussion + Pause café (Organisation : Alexandre Leclerc (Buawei-Lille) et Christian Gout)
    Relations industrielles : autour des projets I-démo SCALE OP et POKAIOK IoT
    (BPI France, Région Normandie, FEDER, Région Hauts-de-France) –
    Présentation Labex AMIES (C. Gout)
    Echanges avec Siemens Gamesa Renewable Energy (Rouen), et Buawei (Lille).

    Salle Bougainville 201– INSA Rouen

    12h15 à 13h45 : REPAS au LMI
     
    13h45 à 14h15 : Accueil café
    Amphi Curie - INSA Rouen
     
    Après-midi : Cinq conférences plénières - orateurs :
     
    14h15 - Giacomo Nardi (LMI, INSA Rouen): 
    Biomechanical modeling of the generation of hematopoietic stem cells
     
    14h45 - Niami Nasr (LMRS, Univ Rouen)
    Méthode numerique de type frontière immergée pour un problème inverse en imagerie medicale : La tomographie par impedance électrique
     
    15h15 - Charles Fauvel (Institut Cribier, CHU Rouen)
    Imagerie cardiovasculaire dans le domaine des valvulopathies au sein de l’Institut Alain Cribier : état des lieux et opportunités à venir
     
    Pause café 
     
    16h15 - Théau Cousin (LMI et Siemens Gamesa) - Scale Op
    Wind velocity field reconstruction
     
    16H45 - Patrick Bousquet-Melou et Benoist Gaston (CRIANN) 
    Injection de connaissance terminologique et de littérature grise en santé dans un LLM Génératif sur infrastructure Multi-GPUs
    (Badisse Dahamna (CHU de Rouen), Romain Lelong  (CHU de Rouen), Benoist Gaston (CRIANN))

    GPU et processeurs vectoriels pour le calcul de fonctions de structure de champs scalaires discontinus
    Fabien Thiesset (CORIA), Alexandre Poux (CORIA), Patrick Bousquet-Mélou (CRIANN)
     
    17h15 : Echanges et discussion + Pause café
     
    20h : Diner Rouen 
     
     
     Titres et résumés des présentations:
     

    Giacomo NARDI     (LMI INSA Rouen/Institut Pasteur) : 
    Biomechanical modeling of the generation of hematopoietic stem cells
    Abstract: Stem cell generation involves specific spatio-temporal geometric patterns resulting from the interaction between mechanical forces and cell signaling. This process can be observed in vivo using time-lapse confocal microscopy imaging, and mathematical modeling plays a central role in rigorously determining the underlying mechanisms and estimating related mechanical cues.
    This presentation outlines the entire process for the 3D modeling of this cellular evolution, which comprises two main steps. First, we propose a novel segmentation method based on persistent homology theory, which allows for a topologically consistent 3D reconstruction of time-lapse acquisitions. Next, a novel shape matching method is proposed to estimate the force triggering the process and the associated optimal displacement.
    The optimality condition is based on elastic equilibrium, founded on Helfrich energy, which is commonly used to model membrane equilibria.
    Compared to classic shape matching methods based on purely geometrical metrics, the proposed approach takes biomechanical constraints into account. A comparison of these approaches is presented for stem cell emergence, highlighting the effectiveness of the proposed method for estimating the forces underlying cell emergence.


    Charles FAUVEL     (Institut Cribier, CHU Rouen) :
    Imagerie cardiovasculaire dans le domaine des valvulopathies au sein de l’Institut Alain Cribier : état des lieux et opportunités à venir

     
     

    Niami NASR     (LMRS, UnivRouen) : 
    Méthode numerique de type frontière immergée pour un problème inverse en imagerie medicale : La tomographie par impedance électrique
    Abstract: Les problèmes inverses se retrouvent dans de nombreuses applications très diverses. L’objectif est de reconstruire une source à l’intérieur d’un domaine à partir de données mesurées sur le bord de ce domaine. Dans cet exposé, je présenterai un exemple issu de l’imagerie médicale : la tomographie par impédance électrique, dont l’objectif est de reconstruire la conductivité à l’intérieur d’un volume à partir de mesures effectuées sur le torse à l’aide d’une ceinture d’électrodes. Pour ce problème, nous proposons une méthode de frontière immergée par différences finies. Nous discuterons de la convergence de cette méthode. Pourquoi une méthode de frontière immergée ? Parce que, dans ce type de problèmes, nous faisons face à des géométries mobiles, ce qui nécessite des étapes de remaillage très coûteuses numériquement lorsqu’on utilise des méthodes classiques à maillage adapté. La méthode de frontière immergée, quant à elle, permet une implémentation implicite de la frontière du domaine, évitant ainsi complètement les étapes de remaillage dans le cas de problèmes à géométrie variable. Ce travail a été réalisé durant ma thèse à l’Inria de Bordeaux, sous la direction de Lisl Weynans et Jérémi Dardé.
     
     
     

    Théau COUSIN     (INSA Rouen/SGRE) : 
    Wind field reconstruction based on LiDAR measurements
    Abstract: Wind turbines experience significant loads due to the wind pressure exerted on their structure. These loads, influenced by various environmental factors, play a crucial role in the durability and performance of the turbines. To ensure optimal management of these structures, it is necessary to predict them accurately. This requirement led to the development of BHawC, a SGRE in-house aero-servo-elastic simulation software for the full wind turbine. This tool uses simulated wind data as input. To enhance its accuracy and bring the simulations closer to reality, the data can be made more resemblant to realistic ones by using wind profiles generated from on-site measurements obtained via ground-based and nacelle-mounted LiDAR. The scope of our contribution is thus to provide a suitable mathematical framework phrased as a minimization problem under incompressibility constraint, exemplified with numerical simulations to reconstruct the wind field from the LiDAR dataset and generate more reliable data to feed the SGRE-handcrafted software.
    This work is funded (in parts) by Région Normandie and ERDF fund via the "I-Démo" SCALE Op project under convention 00152289 ("I-Démo", France, BPI France and France 2030 AAP).
     
     

    Patrick BOUSQUET-MELOU     (CRIANN) :
    GPU et processeurs vectoriels pour le calcul de fonctions de structure de champs scalaires discontinus
    Fabien Thiesset (CORIA), Alexandre Poux (CORIA), Patrick Bousquet-Mélou (CRIANN)
    L'étude des fluctuations spatiales d'un champ scalaire, comme la température dans un écoulement turbulent tridimensionnel, peut faire appel à du calcul de fonctions de structure (ou corrélations de paires). Ce calcul est particulièrement demandeur en ressources numériques car il nécessite six boucles imbriquées sur l'ensemble des paires de points du domaine, impliquant une complexité algorithmique en O(n^6).
    Une application de post-traitement programmée en FORTRAN ayant été développée par l’équipe du CORIA co-auteure de ce travail, son noyau de calcul a été porté sur les architectures accélératrices du CRIANN : GPU NVIDIA A100, GPU AMD MI210 et Vector Engine (VE) de NEC. La dernière (VE) demande de ré-écrire le code en restant en langages standard (FORTRAN, threading OpenMP). Les GPU ont été adressés par les directives de programmation OpenACC [1] et « OpenMP target » [2] (au moyen des compilateurs de NVIDIA et de Cray), mais aussi par ré-écritures du code FORTRAN. Un codage multi-architectures serait nécessaire pour obtenir la meilleure performance sur chaque architecture de processeur.
     
     

    Benoist GASTON     (CRIANN) :
    Injection de connaissance terminologique et de littérature grise en santé dans un LLM Génératif sur infrastructure Multi-GPUs
    Benoist Gaston (CRIANN), Badisse Dahamna (CHU de Rouen), Romain Lelong  (CHU de Rouen)
    L'intégration de connaissances spécialisées dans les modèles de langage de grande taille (LLM) est un enjeu majeur pour améliorer leur performance dans des domaines spécifiques comme la santé. 
    Le projet présenté vise à enrichir un LLM génératif avec des données dites de connaissances en santé, afin de répondre aux objectifs suivants :
    • améliorer la précision et la pertinence des réponses générées
    • étudier l'impact de l'agrégation de connaissances complémentaires dans un même modèle 
    Les besoins en VRAM pour l'entrainement de ce type de modèle nécessitent une approche Model Parallelism.  Pour mener à bien les expérimentations les ressources de calcul du CRIANN (notamment les serveurs munis de GPU NVIDIA A100 ou H200) sont utilisés.
    La présentation porte plus particulièrement sur les différentes approches de fine-tuning envisagées et sur les résultats des premiers tests"
     

     
  • Location: Rouen INSA - 685 Av. de l'Université, 76800 St Etienne du Rouvray

 

Christian Gout - 2025